ОАО «Салаватнефтехимпроект» основано в 1948 году как Ишимбайское отделение «Гипрогазтоппрома» для обеспечения проектной документацией строящихся объектов Комбинат № 18 (ныне ОАО «Салаватнефтеоргсинтез») и города Салавата.

За длительный период своей деятельности ОАО «Салаватнефтехимпроект» неоднократно меняло свое название и ведомственную принадлежность, что было обусловлено масштабами решаемых задач, но основные его функции оставались прежними, а сфера деятельности расширялась.

В 1963 году Ишимбайское отделение «Гипрогазтоппрома» переименовано в Салаватский филиал «Ленгипрогаза» с возложением на него функций генеральной проектной организации ОАО «Салаватнефтеоргсинтез».

С 1974 года институт становится филиалом «Башгипронефтехима».

В 1992 году институт получил статус самостоятельного предприятия и был переименован в «Салаватгипронефтехим», а с 01.01.2011г. был преобразован в ОАО «Салаватнефтехимпроект».

В разные годы по проектам института построено и введено в эксплуатацию большинство объектов «ОАО «Салаватнефтеоргсинтез», в том числе: технологические установки, резервуарные парки, насосные, факельное хозяйство, объекты энергообеспечения, инженерные коммуникации и т.д. При участии специалистов института разрабатывались проекты для Ишимбайского НПЗ, Пермского НПК, Ангарского НХК, Уфимского и Ново-Уфимского и т.д. По проектам института построены и введены в эксплуатацию ряд магистральных продуктопроводов и газопроводов, осуществлено газоснабжение городов Салавата, Ишимбая, Кумертау, поселка Нугуш и других населенных пунктов Республики Башкортостан.

История института неразрывно связана с историей строительства города Салавата. По проектам института в городе Салавате были построены школы, средние и высшие учебные заведения, детские сады, лечебно-профилактические комплексы, Дворец культуры нефтехимиков, предприятия пищевой промышленности и ряд других жизненно важных объектов города.